Os projetos desenvolvidos no PPGECS seguem duas linhas de pesquisa, que são o ensino em ciências e o ensino em saúde. Entretanto, alguns projetos apresentam atividades relacionadas tanto ao ensino em ciências quanto ao ensino em saúde, o que tornou necessário o agrupamento desses projetos em três macroprojetos.
A ideia dos macroprojetos é agrupar os projetos realizados no programa de pós-graduação para dar maior robustez às linhas de pesquisa e aos projetos já vêm sendo realizados ao longo prazo. Nesse sentido, com o objetivo de alinhar os novos projetos e os projetos existentes com os objetivos de melhorar o desempenho e publicações dos projetos desenvolvidos no PPGECS, vão estudo foi realizado com base nas principais palavras apresentadas nos títulos dos projetos já existentes e três macroprojetos foram propostos, como apresentados na figura abaixo.